ToolUniverse

Servidor MCP de mims-harvard

Give AI assistants access to thousands of scientific tools, databases and literature sources for life science and research work.

Se ejecuta en local (Se ejecuta en tu equipo: su página tiene el comando de instalación)Se ejecuta con uvxRequiere clave de API

Instalar ToolUniverse

Se ejecuta en tu equipo. Tu cliente lo inicia con este comando:

uvx tooluniverse

Requiere uv (Python) en tu equipo. Los pasos de configuración de abajo muestran dónde va el comando en cada cliente.

  • OPENAI_API_KEY secreto opcional OpenAI API key for LLM-based tool finding and embedding features
  • ANTHROPIC_API_KEY secreto opcional Anthropic API key for Claude-based features
  • GEMINI_API_KEY secreto opcional Google Gemini API key for Gemini-based features
  • OPENROUTER_API_KEY secreto opcional OpenRouter API key for accessing 100+ LLM models
  • AZURE_OPENAI_API_KEY secreto opcional Azure OpenAI API key (alternative to OpenAI)
  • HF_TOKEN secreto opcional HuggingFace token for accessing models and datasets

Compartir este servidor

El enlace abre esta página, con el comando de instalación y los pasos de configuración.

mcp.tc/i/tooluniverse

Descripción

ToolUniverse is a catalog of scientific tools for AI scientist workflows, covering machine learning models, datasets, APIs and scientific packages. It supports literature search across PubMed, Semantic Scholar, ArXiv, BioRxiv and Europe PMC, plus life science databases for genes, diseases, proteins and drugs. A compact mode reduces the large tool set to a few discovery tools to save context.

It runs locally over stdio from the PyPI package tooluniverse, started with uvx. It needs Python 3.10 or newer. No API key is required to start. Optional keys (NCBI, Semantic Scholar, BioGRID, DisGeNET, OMIM, OncoKB, OpenAI, Anthropic, Gemini, HuggingFace) raise rate limits or enable extra features.

Qué puedes hacer

  • Search literature across PubMed, Semantic Scholar, ArXiv, BioRxiv and Europe PMC
  • Query gene, disease, protein interaction and oncology databases
  • Discover tools through a compact mode with a few core discovery tools
  • Run long tasks asynchronously with progress tracking
  • Chain tools into sequential or parallel workflows
  • Cache results locally for repeat queries and offline use

Herramientas

Los servidores locales muestran sus herramientas cuando están en marcha, y este no publica su lista por adelantado. Tu cliente las muestra después de añadirlo.

Prompts de ejemplo

  • Find recent PubMed papers on KRAS inhibitors in lung cancer

  • Which genes are associated with Marfan syndrome according to DisGeNET?

  • List protein interaction partners of TP53 from BioGRID

  • Search ArXiv and BioRxiv for preprints on protein structure prediction

Configuración

Todos los clientes inician ToolUniverse en tu equipo con el mismo comando. Elige el tuyo; la página recuerda tu elección.

Claude Code

  1. Ejecútalo en un terminal, en la carpeta de tu proyecto:
claude mcp add --transport stdio tooluniverse --env "OPENAI_API_KEY=<YOUR_OPENAI_API_KEY>" --env "ANTHROPIC_API_KEY=<YOUR_ANTHROPIC_API_KEY>" --env "GEMINI_API_KEY=<YOUR_GEMINI_API_KEY>" --env "OPENROUTER_API_KEY=<YOUR_OPENROUTER_API_KEY>" --env "AZURE_OPENAI_API_KEY=<YOUR_AZURE_OPENAI_API_KEY>" --env "HF_TOKEN=<YOUR_HF_TOKEN>" --env "NCBI_API_KEY=<YOUR_NCBI_API_KEY>" --env "SEMANTIC_SCHOLAR_API_KEY=<YOUR_SEMANTIC_SCHOLAR_API_KEY>" -- uvx tooluniverse
  1. Inicia Claude Code y escribe /mcp. tooluniverse debería aparecer como conectado.

Añade --scope user para que esté disponible en todos los proyectos. Sustituye los marcadores por tus propios valores.

Claude Desktop

  1. Abre Settings → Developer → Edit Config. Se abre claude_desktop_config.json. Añade:
claude_desktop_config.json
{
  "mcpServers": {
    "tooluniverse": {
      "command": "uvx",
      "args": [
        "tooluniverse"
      ],
      "env": {
        "OPENAI_API_KEY": "<YOUR_OPENAI_API_KEY>",
        "ANTHROPIC_API_KEY": "<YOUR_ANTHROPIC_API_KEY>",
        "GEMINI_API_KEY": "<YOUR_GEMINI_API_KEY>",
        "OPENROUTER_API_KEY": "<YOUR_OPENROUTER_API_KEY>",
        "AZURE_OPENAI_API_KEY": "<YOUR_AZURE_OPENAI_API_KEY>",
        "HF_TOKEN": "<YOUR_HF_TOKEN>",
        "NCBI_API_KEY": "<YOUR_NCBI_API_KEY>",
        "SEMANTIC_SCHOLAR_API_KEY": "<YOUR_SEMANTIC_SCHOLAR_API_KEY>"
      }
    }
  }
}
  1. Guarda el archivo y reinicia Claude Desktop. Sustituye los marcadores por tus propios valores.

Necesita uv (Python) en tu equipo. El archivo está en ~/Library/Application Support/Claude/ en macOS y en %APPDATA%\Claude\ en Windows.

Cursor

O añádelo a mano en ~/.cursor/mcp.json (todos los proyectos) o en .cursor/mcp.json (este proyecto):

mcp.json
{
  "mcpServers": {
    "tooluniverse": {
      "command": "uvx",
      "args": [
        "tooluniverse"
      ],
      "env": {
        "OPENAI_API_KEY": "<YOUR_OPENAI_API_KEY>",
        "ANTHROPIC_API_KEY": "<YOUR_ANTHROPIC_API_KEY>",
        "GEMINI_API_KEY": "<YOUR_GEMINI_API_KEY>",
        "OPENROUTER_API_KEY": "<YOUR_OPENROUTER_API_KEY>",
        "AZURE_OPENAI_API_KEY": "<YOUR_AZURE_OPENAI_API_KEY>",
        "HF_TOKEN": "<YOUR_HF_TOKEN>",
        "NCBI_API_KEY": "<YOUR_NCBI_API_KEY>",
        "SEMANTIC_SCHOLAR_API_KEY": "<YOUR_SEMANTIC_SCHOLAR_API_KEY>"
      }
    }
  }
}

Necesita uv (Python) en tu equipo. Sustituye los marcadores por tus propios valores.

VS Code

Añádelo a .vscode/mcp.json. VS Code pide el secreto la primera vez y lo guarda de forma segura:

.vscode/mcp.json
{
  "servers": {
    "tooluniverse": {
      "type": "stdio",
      "command": "uvx",
      "args": [
        "tooluniverse"
      ],
      "env": {
        "OPENAI_API_KEY": "${input:openai-api-key}",
        "ANTHROPIC_API_KEY": "${input:anthropic-api-key}",
        "GEMINI_API_KEY": "${input:gemini-api-key}",
        "OPENROUTER_API_KEY": "${input:openrouter-api-key}",
        "AZURE_OPENAI_API_KEY": "${input:azure-openai-api-key}",
        "HF_TOKEN": "${input:hf-token}",
        "NCBI_API_KEY": "${input:ncbi-api-key}",
        "SEMANTIC_SCHOLAR_API_KEY": "${input:semantic-scholar-api-key}"
      }
    }
  },
  "inputs": [
    {
      "type": "promptString",
      "id": "openai-api-key",
      "description": "OPENAI_API_KEY",
      "password": true
    },
    {
      "type": "promptString",
      "id": "anthropic-api-key",
      "description": "ANTHROPIC_API_KEY",
      "password": true
    },
    {
      "type": "promptString",
      "id": "gemini-api-key",
      "description": "GEMINI_API_KEY",
      "password": true
    },
    {
      "type": "promptString",
      "id": "openrouter-api-key",
      "description": "OPENROUTER_API_KEY",
      "password": true
    },
    {
      "type": "promptString",
      "id": "azure-openai-api-key",
      "description": "AZURE_OPENAI_API_KEY",
      "password": true
    },
    {
      "type": "promptString",
      "id": "hf-token",
      "description": "HF_TOKEN",
      "password": true
    },
    {
      "type": "promptString",
      "id": "ncbi-api-key",
      "description": "NCBI_API_KEY",
      "password": true
    },
    {
      "type": "promptString",
      "id": "semantic-scholar-api-key",
      "description": "SEMANTIC_SCHOLAR_API_KEY",
      "password": true
    }
  ]
}

Necesita uv (Python) en tu equipo.

Devin Desktop

  1. Añádelo a ~/.config/devin/mcp_config.json (macOS y Linux) o a %APPDATA%\devin\mcp_config.json (Windows):
mcp_config.json
{
  "mcpServers": {
    "tooluniverse": {
      "command": "uvx",
      "args": [
        "tooluniverse"
      ],
      "env": {
        "OPENAI_API_KEY": "<YOUR_OPENAI_API_KEY>",
        "ANTHROPIC_API_KEY": "<YOUR_ANTHROPIC_API_KEY>",
        "GEMINI_API_KEY": "<YOUR_GEMINI_API_KEY>",
        "OPENROUTER_API_KEY": "<YOUR_OPENROUTER_API_KEY>",
        "AZURE_OPENAI_API_KEY": "<YOUR_AZURE_OPENAI_API_KEY>",
        "HF_TOKEN": "<YOUR_HF_TOKEN>",
        "NCBI_API_KEY": "<YOUR_NCBI_API_KEY>",
        "SEMANTIC_SCHOLAR_API_KEY": "<YOUR_SEMANTIC_SCHOLAR_API_KEY>"
      }
    }
  }
}
  1. Actualiza la lista de servidores MCP en Cascade. Sustituye los marcadores por tus propios valores.

Devin Desktop es el nuevo nombre de Windsurf.

Codex

codex mcp add tooluniverse --env "OPENAI_API_KEY=<YOUR_OPENAI_API_KEY>" --env "ANTHROPIC_API_KEY=<YOUR_ANTHROPIC_API_KEY>" --env "GEMINI_API_KEY=<YOUR_GEMINI_API_KEY>" --env "OPENROUTER_API_KEY=<YOUR_OPENROUTER_API_KEY>" --env "AZURE_OPENAI_API_KEY=<YOUR_AZURE_OPENAI_API_KEY>" --env "HF_TOKEN=<YOUR_HF_TOKEN>" --env "NCBI_API_KEY=<YOUR_NCBI_API_KEY>" --env "SEMANTIC_SCHOLAR_API_KEY=<YOUR_SEMANTIC_SCHOLAR_API_KEY>" -- uvx tooluniverse

O edita directamente ~/.codex/config.toml:

config.toml
[mcp_servers.tooluniverse]
command = "uvx"
args = ["tooluniverse"]
env = { OPENAI_API_KEY = "<YOUR_OPENAI_API_KEY>", ANTHROPIC_API_KEY = "<YOUR_ANTHROPIC_API_KEY>", GEMINI_API_KEY = "<YOUR_GEMINI_API_KEY>", OPENROUTER_API_KEY = "<YOUR_OPENROUTER_API_KEY>", AZURE_OPENAI_API_KEY = "<YOUR_AZURE_OPENAI_API_KEY>", HF_TOKEN = "<YOUR_HF_TOKEN>", NCBI_API_KEY = "<YOUR_NCBI_API_KEY>", SEMANTIC_SCHOLAR_API_KEY = "<YOUR_SEMANTIC_SCHOLAR_API_KEY>" }

Necesita uv (Python) en tu equipo. Sustituye los marcadores por tus propios valores.

Gemini CLI

gemini mcp add -e "OPENAI_API_KEY=<YOUR_OPENAI_API_KEY>" -e "ANTHROPIC_API_KEY=<YOUR_ANTHROPIC_API_KEY>" -e "GEMINI_API_KEY=<YOUR_GEMINI_API_KEY>" -e "OPENROUTER_API_KEY=<YOUR_OPENROUTER_API_KEY>" -e "AZURE_OPENAI_API_KEY=<YOUR_AZURE_OPENAI_API_KEY>" -e "HF_TOKEN=<YOUR_HF_TOKEN>" -e "NCBI_API_KEY=<YOUR_NCBI_API_KEY>" -e "SEMANTIC_SCHOLAR_API_KEY=<YOUR_SEMANTIC_SCHOLAR_API_KEY>" tooluniverse uvx tooluniverse

Así lo añades al proyecto actual. Añade -s user para usarlo en todas partes.

Cualquier cliente

La mayoría de los clientes que inician servidores locales aceptan esta forma:

{
  "mcpServers": {
    "tooluniverse": {
      "command": "uvx",
      "args": [
        "tooluniverse"
      ],
      "env": {
        "OPENAI_API_KEY": "<YOUR_OPENAI_API_KEY>",
        "ANTHROPIC_API_KEY": "<YOUR_ANTHROPIC_API_KEY>",
        "GEMINI_API_KEY": "<YOUR_GEMINI_API_KEY>",
        "OPENROUTER_API_KEY": "<YOUR_OPENROUTER_API_KEY>",
        "AZURE_OPENAI_API_KEY": "<YOUR_AZURE_OPENAI_API_KEY>",
        "HF_TOKEN": "<YOUR_HF_TOKEN>",
        "NCBI_API_KEY": "<YOUR_NCBI_API_KEY>",
        "SEMANTIC_SCHOLAR_API_KEY": "<YOUR_SEMANTIC_SCHOLAR_API_KEY>"
      }
    }
  }
}

Zed pone los servidores bajo context_servers en sus ajustes, con los mismos campos command, args y env.

Necesita uv (Python) en tu equipo. Sustituye los marcadores por tus propios valores.

Insertar

Muestra ToolUniverse en un README o en tu web. Cada inserción enlaza a esta página, usa el comando de instalación del servidor y no instala cookies. Cómo funcionan las inserciones

La tarjeta, el iframe y el JSON están en inglés. Añade ?lang=it, fr, de o es a su dirección para otro idioma.

Insignia para README

Vista previa de la insignia, claraVista previa de la insignia, oscura
Markdown
[![ToolUniverse on mcp.tc](https://mcp.tc/i/tooluniverse/badge.svg)](https://mcp.tc/i/tooluniverse)
HTML
<a href="https://mcp.tc/i/tooluniverse"><img src="https://mcp.tc/i/tooluniverse/badge.svg" alt="ToolUniverse on mcp.tc" height="20"></a>

Sigue el modo claro u oscuro de quien lee. Añade ?theme=light o ?theme=dark para fijarlo, o ?style=compact para mostrar el símbolo sin la palabra.

Tarjeta para web

HTML
<script src="https://mcp.tc/w/tooluniverse.js" async></script>

La tarjeta aparece donde esté la etiqueta. Añade data-theme="dark" o data-size="compact" a la etiqueta para cambiarla. El archivo contiene todo lo que necesita, así que no hace otras solicitudes ni instala cookies.

iframe

HTML
<iframe src="https://mcp.tc/embed/tooluniverse" title="ToolUniverse on mcp.tc" width="420" height="200" loading="lazy" allow="clipboard-write" style="border:0;border-radius:8px;max-width:100%"></iframe>

Úsalo en páginas que no permiten scripts. Añade ?theme=light o ?theme=dark a la dirección para fijar los colores.

JSON

La ficha como datos para tus propias páginas y herramientas: nombre, descripción corta, comando de instalación, herramientas y los enlaces «Add to». Cualquier web puede leerla (CORS abierto).

https://mcp.tc/i/tooluniverse.json

Qué significa cada campo

Prompt para la IA

Pégalo en un asistente de programación con IA, como Claude Code o Cursor, y añadirá la tarjeta de ToolUniverse a tu web.

Markdown
Añade a mi web la tarjeta de mcp.tc de ToolUniverse, un servidor MCP. Es un solo script estático: sin paso de build, sin paquetes que instalar, sin cookies.

Pon esta etiqueta donde deba aparecer la tarjeta. La tarjeta se muestra justo antes de ella:

```html
<script src="https://mcp.tc/w/tooluniverse.js" async></script>
```

Para mostrarla en otro sitio, pon allí este marcador y carga el mismo script una sola vez, por ejemplo antes de `</body>`. Deja el enlace dentro: lo ven los visitantes sin JavaScript.

```html
<div data-mcptc="tooluniverse"><a href="https://mcp.tc/i/tooluniverse">ToolUniverse on mcp.tc</a></div>
```

Opciones:
- `data-theme="light"` o `"dark"` en la etiqueta o el marcador fija los colores. Sin él, la tarjeta sigue el modo claro u oscuro del visitante.
- `data-size="compact"` da una tarjeta más pequeña, sin el eslogan.
- La variable CSS `--mcptc-max-width` en el marcador o en un elemento padre fija el ancho (por defecto `520px`).
- `?lang=` en la URL del script fija el idioma de la tarjeta: `en`, `it`, `fr`, `de` o `es`.

Si el sitio tiene una Content Security Policy, permite `script-src https://mcp.tc` e `img-src data:` (el icono va incrustado).

Para un README u otra documentación en Markdown, usa la insignia:

```markdown
[![ToolUniverse on mcp.tc](https://mcp.tc/i/tooluniverse/badge.svg)](https://mcp.tc/i/tooluniverse)
```

Referencia: https://mcp.tc/es/embed

Historial de cambios

Este servidor se ejecuta en tu ordenador, así que seguimos su paquete de PyPI: cada versión nueva aparece aquí, junto con las ediciones de su responsable.

Sigue ToolUniverse y te enviaremos un correo cuando algo cambie.

  1. , Comprobación automática

    Inicio del seguimiento: versión 1.5.6.

Preguntas frecuentes

¿Puedo pegar mcp.tc/i/tooluniverse en mi cliente MCP?

No. ToolUniverse se ejecuta en tu propio equipo, iniciado por tu cliente, así que no tiene una dirección web a la que conectarse. El enlace rápido es la página para compartir; el comando de instalación es uvx tooluniverse.

¿ToolUniverse necesita una clave de API?

Sí. Lee OPENAI_API_KEY, ANTHROPIC_API_KEY, GEMINI_API_KEY, OPENROUTER_API_KEY, AZURE_OPENAI_API_KEY, HF_TOKEN, NCBI_API_KEY y SEMANTIC_SCHOLAR_API_KEY de su entorno, y OPENAI_API_KEY, ANTHROPIC_API_KEY, GEMINI_API_KEY, OPENROUTER_API_KEY, AZURE_OPENAI_API_KEY, HF_TOKEN, NCBI_API_KEY y SEMANTIC_SCHOLAR_API_KEY son secretos. Pon los valores en la configuración de tu cliente en tu propio equipo, nunca en un archivo compartido.

¿ToolUniverse es un servidor remoto o local?

Local. Tu cliente lo inicia como un proceso en tu equipo con uvx tooluniverse, que necesita uv (Python).

¿Qué clientes pueden usarlo?

Cualquier cliente que inicie servidores locales: Claude Code, Claude Desktop, Cursor, VS Code, Devin Desktop, Codex, Gemini CLI, Zed y otros. claude.ai y ChatGPT solo se conectan a servidores remotos.

¿mcp.tc sigue los cambios de ToolUniverse?

En parte. Se ejecuta en tu ordenador, así que seguimos su paquete de PyPI: su pestaña Historial muestra cada versión nueva y las ediciones de su responsable. Sigue la ficha para recibir un correo cuando cambie.

¿Quién escribió esta página?

El robot de mcp.tc leyó los metadatos públicos de ToolUniverse (las páginas de su paquete y de su repositorio), y un modelo de IA redactó el texto a partir de ellos. Una persona revisa todo lo que las comprobaciones no pueden confirmar. Aun así, el texto puede contener errores, así que si encuentras uno, usa Reportar esta ficha en esta página.

mcp.tc no tiene relación con mims-harvard. Esta página se creó a partir de los metadatos públicos de ToolUniverse, comprobados por última vez el 6 oct 2026, y un modelo de IA escribió la descripción, así que puede contener errores. Los nombres y marcas pertenecen a sus titulares. ¿Algo no cuadra? Reportar esta ficha.