ToolUniverse

Q: ToolUniverse a-t-il besoin d’une clé API ?

Oui. Il lit OPENAI_API_KEY, ANTHROPIC_API_KEY, GEMINI_API_KEY, OPENROUTER_API_KEY, AZURE_OPENAI_API_KEY, HF_TOKEN, NCBI_API_KEY et SEMANTIC_SCHOLAR_API_KEY dans son environnement, et OPENAI_API_KEY, ANTHROPIC_API_KEY, GEMINI_API_KEY, OPENROUTER_API_KEY, AZURE_OPENAI_API_KEY, HF_TOKEN, NCBI_API_KEY et SEMANTIC_SCHOLAR_API_KEY sont des secrets. Mettez les valeurs dans la configuration de votre client, sur votre propre machine, jamais dans un fichier partagé.

Serveur MCP par mims-harvard

Give AI assistants access to thousands of scientific tools, databases and literature sources for life science and research work.

S’exécute en localS’exécute avec uvxClé API requise

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Installer ToolUniverse

Tourne sur votre machine. Votre client le lance avec cette commande :

uvx tooluniverse

Nécessite uv (Python) sur votre ordinateur. Les étapes ci-dessous montrent où placer la commande dans chaque client.

OPENAI_API_KEY secret facultatif OpenAI API key for LLM-based tool finding and embedding features
ANTHROPIC_API_KEY secret facultatif Anthropic API key for Claude-based features
GEMINI_API_KEY secret facultatif Google Gemini API key for Gemini-based features
OPENROUTER_API_KEY secret facultatif OpenRouter API key for accessing 100+ LLM models
AZURE_OPENAI_API_KEY secret facultatif Azure OpenAI API key (alternative to OpenAI)
HF_TOKEN secret facultatif HuggingFace token for accessing models and datasets

Présentation

ToolUniverse is a catalog of scientific tools for AI scientist workflows, covering machine learning models, datasets, APIs and scientific packages. It supports literature search across PubMed, Semantic Scholar, ArXiv, BioRxiv and Europe PMC, plus life science databases for genes, diseases, proteins and drugs. A compact mode reduces the large tool set to a few discovery tools to save context.

It runs locally over stdio from the PyPI package tooluniverse, started with uvx. It needs Python 3.10 or newer. No API key is required to start. Optional keys (NCBI, Semantic Scholar, BioGRID, DisGeNET, OMIM, OncoKB, OpenAI, Anthropic, Gemini, HuggingFace) raise rate limits or enable extra features.

Ce que vous pouvez faire

Search literature across PubMed, Semantic Scholar, ArXiv, BioRxiv and Europe PMC
Query gene, disease, protein interaction and oncology databases
Discover tools through a compact mode with a few core discovery tools
Run long tasks asynchronously with progress tracking
Chain tools into sequential or parallel workflows
Cache results locally for repeat queries and offline use

Outils

Les serveurs locaux présentent leurs outils une fois lancés, et celui-ci ne publie pas sa liste à l’avance. Votre client les affiche après l’ajout.

Exemples de prompts

Find recent PubMed papers on KRAS inhibitors in lung cancer
Which genes are associated with Marfan syndrome according to DisGeNET?
List protein interaction partners of TP53 from BioGRID
Search ArXiv and BioRxiv for preprints on protein structure prediction

Configuration

Chaque client lance ToolUniverse sur votre machine avec la même commande. Choisissez le vôtre ; la page retient votre choix.

Claude Code

Lancez ceci dans un terminal, dans le dossier de votre projet :

claude mcp add --transport stdio tooluniverse --env "OPENAI_API_KEY=<YOUR_OPENAI_API_KEY>" --env "ANTHROPIC_API_KEY=<YOUR_ANTHROPIC_API_KEY>" --env "GEMINI_API_KEY=<YOUR_GEMINI_API_KEY>" --env "OPENROUTER_API_KEY=<YOUR_OPENROUTER_API_KEY>" --env "AZURE_OPENAI_API_KEY=<YOUR_AZURE_OPENAI_API_KEY>" --env "HF_TOKEN=<YOUR_HF_TOKEN>" --env "NCBI_API_KEY=<YOUR_NCBI_API_KEY>" --env "SEMANTIC_SCHOLAR_API_KEY=<YOUR_SEMANTIC_SCHOLAR_API_KEY>" -- uvx tooluniverse

Démarrez Claude Code et tapez /mcp. tooluniverse devrait apparaître comme connecté.

Ajoutez --scope user pour le rendre disponible dans tous vos projets. Remplacez les espaces réservés par vos propres valeurs.

Claude Desktop

Ouvrez Settings → Developer → Edit Config. Cela ouvre claude_desktop_config.json. Ajoutez :

claude_desktop_config.json

{
  "mcpServers": {
    "tooluniverse": {
      "command": "uvx",
      "args": [
        "tooluniverse"
      ],
      "env": {
        "OPENAI_API_KEY": "<YOUR_OPENAI_API_KEY>",
        "ANTHROPIC_API_KEY": "<YOUR_ANTHROPIC_API_KEY>",
        "GEMINI_API_KEY": "<YOUR_GEMINI_API_KEY>",
        "OPENROUTER_API_KEY": "<YOUR_OPENROUTER_API_KEY>",
        "AZURE_OPENAI_API_KEY": "<YOUR_AZURE_OPENAI_API_KEY>",
        "HF_TOKEN": "<YOUR_HF_TOKEN>",
        "NCBI_API_KEY": "<YOUR_NCBI_API_KEY>",
        "SEMANTIC_SCHOLAR_API_KEY": "<YOUR_SEMANTIC_SCHOLAR_API_KEY>"
      }
    }
  }
}

Enregistrez le fichier et redémarrez Claude Desktop. Remplacez les espaces réservés par vos propres valeurs.

Nécessite uv (Python) sur votre ordinateur. Le fichier se trouve dans ~/Library/Application Support/Claude/ sous macOS et dans %APPDATA%\Claude\ sous Windows.

Cursor

Ou ajoutez-le à la main dans ~/.cursor/mcp.json (tous les projets) ou .cursor/mcp.json (ce projet) :

mcp.json

{
  "mcpServers": {
    "tooluniverse": {
      "command": "uvx",
      "args": [
        "tooluniverse"
      ],
      "env": {
        "OPENAI_API_KEY": "<YOUR_OPENAI_API_KEY>",
        "ANTHROPIC_API_KEY": "<YOUR_ANTHROPIC_API_KEY>",
        "GEMINI_API_KEY": "<YOUR_GEMINI_API_KEY>",
        "OPENROUTER_API_KEY": "<YOUR_OPENROUTER_API_KEY>",
        "AZURE_OPENAI_API_KEY": "<YOUR_AZURE_OPENAI_API_KEY>",
        "HF_TOKEN": "<YOUR_HF_TOKEN>",
        "NCBI_API_KEY": "<YOUR_NCBI_API_KEY>",
        "SEMANTIC_SCHOLAR_API_KEY": "<YOUR_SEMANTIC_SCHOLAR_API_KEY>"
      }
    }
  }
}

Nécessite uv (Python) sur votre ordinateur. Remplacez les espaces réservés par vos propres valeurs.

VS Code

Ajoutez-le à .vscode/mcp.json. VS Code demande le secret la première fois et le stocke de façon sécurisée :

.vscode/mcp.json

{
  "servers": {
    "tooluniverse": {
      "type": "stdio",
      "command": "uvx",
      "args": [
        "tooluniverse"
      ],
      "env": {
        "OPENAI_API_KEY": "${input:openai-api-key}",
        "ANTHROPIC_API_KEY": "${input:anthropic-api-key}",
        "GEMINI_API_KEY": "${input:gemini-api-key}",
        "OPENROUTER_API_KEY": "${input:openrouter-api-key}",
        "AZURE_OPENAI_API_KEY": "${input:azure-openai-api-key}",
        "HF_TOKEN": "${input:hf-token}",
        "NCBI_API_KEY": "${input:ncbi-api-key}",
        "SEMANTIC_SCHOLAR_API_KEY": "${input:semantic-scholar-api-key}"
      }
    }
  },
  "inputs": [
    {
      "type": "promptString",
      "id": "openai-api-key",
      "description": "OPENAI_API_KEY",
      "password": true
    },
    {
      "type": "promptString",
      "id": "anthropic-api-key",
      "description": "ANTHROPIC_API_KEY",
      "password": true
    },
    {
      "type": "promptString",
      "id": "gemini-api-key",
      "description": "GEMINI_API_KEY",
      "password": true
    },
    {
      "type": "promptString",
      "id": "openrouter-api-key",
      "description": "OPENROUTER_API_KEY",
      "password": true
    },
    {
      "type": "promptString",
      "id": "azure-openai-api-key",
      "description": "AZURE_OPENAI_API_KEY",
      "password": true
    },
    {
      "type": "promptString",
      "id": "hf-token",
      "description": "HF_TOKEN",
      "password": true
    },
    {
      "type": "promptString",
      "id": "ncbi-api-key",
      "description": "NCBI_API_KEY",
      "password": true
    },
    {
      "type": "promptString",
      "id": "semantic-scholar-api-key",
      "description": "SEMANTIC_SCHOLAR_API_KEY",
      "password": true
    }
  ]
}

Nécessite uv (Python) sur votre ordinateur.

Devin Desktop

Ajoutez-le à ~/.config/devin/mcp_config.json (macOS et Linux) ou %APPDATA%\devin\mcp_config.json (Windows) :

mcp_config.json

{
  "mcpServers": {
    "tooluniverse": {
      "command": "uvx",
      "args": [
        "tooluniverse"
      ],
      "env": {
        "OPENAI_API_KEY": "<YOUR_OPENAI_API_KEY>",
        "ANTHROPIC_API_KEY": "<YOUR_ANTHROPIC_API_KEY>",
        "GEMINI_API_KEY": "<YOUR_GEMINI_API_KEY>",
        "OPENROUTER_API_KEY": "<YOUR_OPENROUTER_API_KEY>",
        "AZURE_OPENAI_API_KEY": "<YOUR_AZURE_OPENAI_API_KEY>",
        "HF_TOKEN": "<YOUR_HF_TOKEN>",
        "NCBI_API_KEY": "<YOUR_NCBI_API_KEY>",
        "SEMANTIC_SCHOLAR_API_KEY": "<YOUR_SEMANTIC_SCHOLAR_API_KEY>"
      }
    }
  }
}

Actualisez la liste des serveurs MCP dans Cascade. Remplacez les espaces réservés par vos propres valeurs.

Devin Desktop est le nouveau nom de Windsurf.

Codex

codex mcp add tooluniverse --env "OPENAI_API_KEY=<YOUR_OPENAI_API_KEY>" --env "ANTHROPIC_API_KEY=<YOUR_ANTHROPIC_API_KEY>" --env "GEMINI_API_KEY=<YOUR_GEMINI_API_KEY>" --env "OPENROUTER_API_KEY=<YOUR_OPENROUTER_API_KEY>" --env "AZURE_OPENAI_API_KEY=<YOUR_AZURE_OPENAI_API_KEY>" --env "HF_TOKEN=<YOUR_HF_TOKEN>" --env "NCBI_API_KEY=<YOUR_NCBI_API_KEY>" --env "SEMANTIC_SCHOLAR_API_KEY=<YOUR_SEMANTIC_SCHOLAR_API_KEY>" -- uvx tooluniverse

Ou modifiez directement ~/.codex/config.toml :

config.toml

[mcp_servers.tooluniverse]
command = "uvx"
args = ["tooluniverse"]
env = { OPENAI_API_KEY = "<YOUR_OPENAI_API_KEY>", ANTHROPIC_API_KEY = "<YOUR_ANTHROPIC_API_KEY>", GEMINI_API_KEY = "<YOUR_GEMINI_API_KEY>", OPENROUTER_API_KEY = "<YOUR_OPENROUTER_API_KEY>", AZURE_OPENAI_API_KEY = "<YOUR_AZURE_OPENAI_API_KEY>", HF_TOKEN = "<YOUR_HF_TOKEN>", NCBI_API_KEY = "<YOUR_NCBI_API_KEY>", SEMANTIC_SCHOLAR_API_KEY = "<YOUR_SEMANTIC_SCHOLAR_API_KEY>" }

Nécessite uv (Python) sur votre ordinateur. Remplacez les espaces réservés par vos propres valeurs.

Gemini CLI

gemini mcp add -e "OPENAI_API_KEY=<YOUR_OPENAI_API_KEY>" -e "ANTHROPIC_API_KEY=<YOUR_ANTHROPIC_API_KEY>" -e "GEMINI_API_KEY=<YOUR_GEMINI_API_KEY>" -e "OPENROUTER_API_KEY=<YOUR_OPENROUTER_API_KEY>" -e "AZURE_OPENAI_API_KEY=<YOUR_AZURE_OPENAI_API_KEY>" -e "HF_TOKEN=<YOUR_HF_TOKEN>" -e "NCBI_API_KEY=<YOUR_NCBI_API_KEY>" -e "SEMANTIC_SCHOLAR_API_KEY=<YOUR_SEMANTIC_SCHOLAR_API_KEY>" tooluniverse uvx tooluniverse

Cela l’ajoute au projet en cours. Ajoutez -s user pour l’utiliser partout.

Tout client

La plupart des clients qui lancent des serveurs locaux acceptent cette forme :

{
  "mcpServers": {
    "tooluniverse": {
      "command": "uvx",
      "args": [
        "tooluniverse"
      ],
      "env": {
        "OPENAI_API_KEY": "<YOUR_OPENAI_API_KEY>",
        "ANTHROPIC_API_KEY": "<YOUR_ANTHROPIC_API_KEY>",
        "GEMINI_API_KEY": "<YOUR_GEMINI_API_KEY>",
        "OPENROUTER_API_KEY": "<YOUR_OPENROUTER_API_KEY>",
        "AZURE_OPENAI_API_KEY": "<YOUR_AZURE_OPENAI_API_KEY>",
        "HF_TOKEN": "<YOUR_HF_TOKEN>",
        "NCBI_API_KEY": "<YOUR_NCBI_API_KEY>",
        "SEMANTIC_SCHOLAR_API_KEY": "<YOUR_SEMANTIC_SCHOLAR_API_KEY>"
      }
    }
  }
}

Zed place les serveurs sous context_servers dans ses réglages, avec les mêmes champs command, args et env.

Nécessite uv (Python) sur votre ordinateur. Remplacez les espaces réservés par vos propres valeurs.

Intégrer

Affichez ToolUniverse dans un README ou sur votre site. Chaque intégration renvoie à cette page, utilise la commande d’installation du serveur et ne dépose aucun cookie. Comment fonctionnent les intégrations

Langue de l’intégration

La carte, l’iframe et le JSON sont en anglais. Ajoutez ?lang=it, fr, de ou es à leur adresse pour une autre langue.

Badge pour README

Markdown

[![ToolUniverse on mcp.tc](https://mcp.tc/i/tooluniverse/badge.svg)](https://mcp.tc/i/tooluniverse)

HTML

<a href="https://mcp.tc/i/tooluniverse"><img src="https://mcp.tc/i/tooluniverse/badge.svg" alt="ToolUniverse on mcp.tc" height="20"></a>

Il suit le mode clair ou sombre du lecteur. Ajoutez ?theme=light ou ?theme=dark pour le fixer, ou ?style=compact pour afficher le symbole sans le nom.

Carte pour site web

HTML

<script src="https://mcp.tc/w/tooluniverse.js" async></script>

La carte apparaît à l’endroit de la balise. Ajoutez data-theme="dark" ou data-size="compact" à la balise pour la modifier. Le fichier contient tout ce qu’il lui faut : il ne fait aucune autre requête et ne dépose aucun cookie.

iframe

HTML

<iframe src="https://mcp.tc/embed/tooluniverse" title="ToolUniverse on mcp.tc" width="420" height="200" loading="lazy" allow="clipboard-write" style="border:0;border-radius:8px;max-width:100%"></iframe>

Utilisez-la sur les pages qui n’autorisent pas les scripts. Ajoutez ?theme=light ou ?theme=dark à l’adresse pour fixer les couleurs.

JSON

La fiche sous forme de données pour vos pages et vos outils : nom, accroche, commande d’installation, outils et liens « Add to ». N’importe quel site peut la lire (CORS ouvert).

https://mcp.tc/i/tooluniverse.json

Ce que signifie chaque champ

Prompt pour l’IA

Collez-le dans un assistant de code IA, comme Claude Code ou Cursor, et il ajoutera la carte de ToolUniverse à votre site.

Markdown

Ajoute à mon site la carte mcp.tc de ToolUniverse, un serveur MCP. C’est un seul script statique : pas de build, aucun paquet à installer, aucun cookie.

Place cette balise là où la carte doit apparaître. La carte s’affiche juste avant elle :

```html
<script src="https://mcp.tc/w/tooluniverse.js" async></script>
```

Pour l’afficher ailleurs, mets ce conteneur à cet endroit et charge le même script une seule fois, par exemple avant `</body>`. Garde le lien à l’intérieur : les visiteurs sans JavaScript le voient.

```html
<div data-mcptc="tooluniverse"><a href="https://mcp.tc/i/tooluniverse">ToolUniverse on mcp.tc</a></div>
```

Options :
- `data-theme="light"` ou `"dark"` sur la balise ou le conteneur fixe les couleurs. Sans cela, la carte suit le mode clair ou sombre du visiteur.
- `data-size="compact"` donne une carte plus petite, sans l’accroche.
- La variable CSS `--mcptc-max-width` sur le conteneur ou un parent fixe la largeur (`520px` par défaut).
- `?lang=` dans l’URL du script choisit la langue de la carte : `en`, `it`, `fr`, `de` ou `es`.

Si le site a une Content Security Policy, autorise `script-src https://mcp.tc` et `img-src data:` (l’icône est intégrée).

Pour un README ou une autre doc en Markdown, utilise plutôt le badge :

```markdown
[![ToolUniverse on mcp.tc](https://mcp.tc/i/tooluniverse/badge.svg)](https://mcp.tc/i/tooluniverse)
```

Référence : https://mcp.tc/fr/embed

Historique des changements

Ce serveur tourne sur votre ordinateur, donc nous suivons son paquet PyPI : chaque nouvelle version apparaît ici, avec les modifications de son propriétaire.

Suivez ToolUniverse et nous vous enverrons un e-mail quand quelque chose change.

Suivre Flux Atom

6 oct. 2026, 21:23 UTC, Vérification automatique

Début de l’observation : version 1.5.6.

FAQ

Puis-je coller mcp.tc/i/tooluniverse dans mon client MCP ?

Non. ToolUniverse tourne sur votre propre ordinateur, lancé par votre client, il n’a donc pas d’adresse web à laquelle se connecter. Le lien rapide est la page à partager ; la commande d’installation est uvx tooluniverse.

ToolUniverse a-t-il besoin d’une clé API ?

Oui. Il lit OPENAI_API_KEY, ANTHROPIC_API_KEY, GEMINI_API_KEY, OPENROUTER_API_KEY, AZURE_OPENAI_API_KEY, HF_TOKEN, NCBI_API_KEY et SEMANTIC_SCHOLAR_API_KEY dans son environnement, et OPENAI_API_KEY, ANTHROPIC_API_KEY, GEMINI_API_KEY, OPENROUTER_API_KEY, AZURE_OPENAI_API_KEY, HF_TOKEN, NCBI_API_KEY et SEMANTIC_SCHOLAR_API_KEY sont des secrets. Mettez les valeurs dans la configuration de votre client, sur votre propre machine, jamais dans un fichier partagé.

ToolUniverse est-il un serveur distant ou local ?

Local. Votre client le lance comme un processus sur votre ordinateur avec uvx tooluniverse, qui nécessite uv (Python).

Quels clients peuvent l’utiliser ?

Tout client qui lance des serveurs locaux : Claude Code, Claude Desktop, Cursor, VS Code, Devin Desktop, Codex, Gemini CLI, Zed et d’autres. claude.ai et ChatGPT ne se connectent qu’à des serveurs distants.

mcp.tc suit-il les changements de ToolUniverse ?

En partie. Il tourne sur votre ordinateur, donc nous suivons son paquet PyPI : son onglet Historique montre chaque nouvelle version et les modifications de son propriétaire. Suivez la fiche pour recevoir un e-mail quand elle change.

Qui a rédigé cette page ?

Le robot de mcp.tc a lu les métadonnées publiques de ToolUniverse (ses pages de paquet et de dépôt), et un modèle d’IA en a tiré le texte. Une personne examine tout ce que les vérifications ne peuvent pas confirmer. Le texte peut encore contenir des erreurs : si vous en repérez une, utilisez Signaler cette fiche sur cette page.

mcp.tc n’est pas affilié à mims-harvard. Cette page a été construite à partir des métadonnées publiques de ToolUniverse, vérifiées pour la dernière fois le 6 oct. 2026, et un modèle d’IA a rédigé la description : elle peut contenir des erreurs. Les noms et marques appartiennent à leurs propriétaires. Quelque chose cloche ? Signaler cette fiche.

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Claude Code

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