ToolUniverse

MCP-Server von mims-harvard

Give AI assistants access to thousands of scientific tools, databases and literature sources for life science and research work.

Läuft lokal (Läuft auf deinem Rechner: Die Seite nennt den Installationsbefehl)Läuft mit uvxAPI-Schlüssel nötig

ToolUniverse installieren

Läuft auf deinem Rechner. Dein Client startet ihn mit diesem Befehl:

uvx tooluniverse

Braucht uv (Python) auf deinem Rechner. Die Schritte unten zeigen, wo der Befehl in jedem Client hingehört.

  • OPENAI_API_KEY geheim optional OpenAI API key for LLM-based tool finding and embedding features
  • ANTHROPIC_API_KEY geheim optional Anthropic API key for Claude-based features
  • GEMINI_API_KEY geheim optional Google Gemini API key for Gemini-based features
  • OPENROUTER_API_KEY geheim optional OpenRouter API key for accessing 100+ LLM models
  • AZURE_OPENAI_API_KEY geheim optional Azure OpenAI API key (alternative to OpenAI)
  • HF_TOKEN geheim optional HuggingFace token for accessing models and datasets

Diesen Server teilen

Öffnet diese Seite mit dem Installationsbefehl und den Einrichtungsschritten.

mcp.tc/i/tooluniverse

Über den Server

ToolUniverse is a catalog of scientific tools for AI scientist workflows, covering machine learning models, datasets, APIs and scientific packages. It supports literature search across PubMed, Semantic Scholar, ArXiv, BioRxiv and Europe PMC, plus life science databases for genes, diseases, proteins and drugs. A compact mode reduces the large tool set to a few discovery tools to save context.

It runs locally over stdio from the PyPI package tooluniverse, started with uvx. It needs Python 3.10 or newer. No API key is required to start. Optional keys (NCBI, Semantic Scholar, BioGRID, DisGeNET, OMIM, OncoKB, OpenAI, Anthropic, Gemini, HuggingFace) raise rate limits or enable extra features.

Was du damit machen kannst

  • Search literature across PubMed, Semantic Scholar, ArXiv, BioRxiv and Europe PMC
  • Query gene, disease, protein interaction and oncology databases
  • Discover tools through a compact mode with a few core discovery tools
  • Run long tasks asynchronously with progress tracking
  • Chain tools into sequential or parallel workflows
  • Cache results locally for repeat queries and offline use

Tools

Lokale Server zeigen ihre Tools erst, wenn sie laufen, und dieser veröffentlicht seine Liste nicht vorab. Dein Client zeigt sie, nachdem du ihn hinzugefügt hast.

Beispiel-Prompts

  • Find recent PubMed papers on KRAS inhibitors in lung cancer

  • Which genes are associated with Marfan syndrome according to DisGeNET?

  • List protein interaction partners of TP53 from BioGRID

  • Search ArXiv and BioRxiv for preprints on protein structure prediction

Einrichtung

Jeder Client startet ToolUniverse mit demselben Befehl auf deinem Rechner. Wähl deinen; die Seite merkt sich deine Wahl.

Claude Code

  1. Führe das in einem Terminal in deinem Projektordner aus:
claude mcp add --transport stdio tooluniverse --env "OPENAI_API_KEY=<YOUR_OPENAI_API_KEY>" --env "ANTHROPIC_API_KEY=<YOUR_ANTHROPIC_API_KEY>" --env "GEMINI_API_KEY=<YOUR_GEMINI_API_KEY>" --env "OPENROUTER_API_KEY=<YOUR_OPENROUTER_API_KEY>" --env "AZURE_OPENAI_API_KEY=<YOUR_AZURE_OPENAI_API_KEY>" --env "HF_TOKEN=<YOUR_HF_TOKEN>" --env "NCBI_API_KEY=<YOUR_NCBI_API_KEY>" --env "SEMANTIC_SCHOLAR_API_KEY=<YOUR_SEMANTIC_SCHOLAR_API_KEY>" -- uvx tooluniverse
  1. Starte Claude Code und tippe /mcp. tooluniverse sollte als verbunden angezeigt werden.

Ergänze --scope user, damit er in jedem Projekt verfügbar ist. Ersetze die Platzhalter durch deine eigenen Werte.

Claude Desktop

  1. Öffne Settings → Developer → Edit Config. Das öffnet claude_desktop_config.json. Füge hinzu:
claude_desktop_config.json
{
  "mcpServers": {
    "tooluniverse": {
      "command": "uvx",
      "args": [
        "tooluniverse"
      ],
      "env": {
        "OPENAI_API_KEY": "<YOUR_OPENAI_API_KEY>",
        "ANTHROPIC_API_KEY": "<YOUR_ANTHROPIC_API_KEY>",
        "GEMINI_API_KEY": "<YOUR_GEMINI_API_KEY>",
        "OPENROUTER_API_KEY": "<YOUR_OPENROUTER_API_KEY>",
        "AZURE_OPENAI_API_KEY": "<YOUR_AZURE_OPENAI_API_KEY>",
        "HF_TOKEN": "<YOUR_HF_TOKEN>",
        "NCBI_API_KEY": "<YOUR_NCBI_API_KEY>",
        "SEMANTIC_SCHOLAR_API_KEY": "<YOUR_SEMANTIC_SCHOLAR_API_KEY>"
      }
    }
  }
}
  1. Speichere die Datei und starte Claude Desktop neu. Ersetze die Platzhalter durch deine eigenen Werte.

Braucht uv (Python) auf deinem Rechner. Die Datei liegt unter macOS in ~/Library/Application Support/Claude/ und unter Windows in %APPDATA%\Claude\.

Cursor

Oder trag ihn von Hand in ~/.cursor/mcp.json (alle Projekte) oder .cursor/mcp.json (dieses Projekt) ein:

mcp.json
{
  "mcpServers": {
    "tooluniverse": {
      "command": "uvx",
      "args": [
        "tooluniverse"
      ],
      "env": {
        "OPENAI_API_KEY": "<YOUR_OPENAI_API_KEY>",
        "ANTHROPIC_API_KEY": "<YOUR_ANTHROPIC_API_KEY>",
        "GEMINI_API_KEY": "<YOUR_GEMINI_API_KEY>",
        "OPENROUTER_API_KEY": "<YOUR_OPENROUTER_API_KEY>",
        "AZURE_OPENAI_API_KEY": "<YOUR_AZURE_OPENAI_API_KEY>",
        "HF_TOKEN": "<YOUR_HF_TOKEN>",
        "NCBI_API_KEY": "<YOUR_NCBI_API_KEY>",
        "SEMANTIC_SCHOLAR_API_KEY": "<YOUR_SEMANTIC_SCHOLAR_API_KEY>"
      }
    }
  }
}

Braucht uv (Python) auf deinem Rechner. Ersetze die Platzhalter durch deine eigenen Werte.

VS Code

Füge ihn zu .vscode/mcp.json hinzu. VS Code fragt beim ersten Mal nach dem Secret und speichert es sicher:

.vscode/mcp.json
{
  "servers": {
    "tooluniverse": {
      "type": "stdio",
      "command": "uvx",
      "args": [
        "tooluniverse"
      ],
      "env": {
        "OPENAI_API_KEY": "${input:openai-api-key}",
        "ANTHROPIC_API_KEY": "${input:anthropic-api-key}",
        "GEMINI_API_KEY": "${input:gemini-api-key}",
        "OPENROUTER_API_KEY": "${input:openrouter-api-key}",
        "AZURE_OPENAI_API_KEY": "${input:azure-openai-api-key}",
        "HF_TOKEN": "${input:hf-token}",
        "NCBI_API_KEY": "${input:ncbi-api-key}",
        "SEMANTIC_SCHOLAR_API_KEY": "${input:semantic-scholar-api-key}"
      }
    }
  },
  "inputs": [
    {
      "type": "promptString",
      "id": "openai-api-key",
      "description": "OPENAI_API_KEY",
      "password": true
    },
    {
      "type": "promptString",
      "id": "anthropic-api-key",
      "description": "ANTHROPIC_API_KEY",
      "password": true
    },
    {
      "type": "promptString",
      "id": "gemini-api-key",
      "description": "GEMINI_API_KEY",
      "password": true
    },
    {
      "type": "promptString",
      "id": "openrouter-api-key",
      "description": "OPENROUTER_API_KEY",
      "password": true
    },
    {
      "type": "promptString",
      "id": "azure-openai-api-key",
      "description": "AZURE_OPENAI_API_KEY",
      "password": true
    },
    {
      "type": "promptString",
      "id": "hf-token",
      "description": "HF_TOKEN",
      "password": true
    },
    {
      "type": "promptString",
      "id": "ncbi-api-key",
      "description": "NCBI_API_KEY",
      "password": true
    },
    {
      "type": "promptString",
      "id": "semantic-scholar-api-key",
      "description": "SEMANTIC_SCHOLAR_API_KEY",
      "password": true
    }
  ]
}

Braucht uv (Python) auf deinem Rechner.

Devin Desktop

  1. Füge ihn zu ~/.config/devin/mcp_config.json (macOS und Linux) oder %APPDATA%\devin\mcp_config.json (Windows) hinzu:
mcp_config.json
{
  "mcpServers": {
    "tooluniverse": {
      "command": "uvx",
      "args": [
        "tooluniverse"
      ],
      "env": {
        "OPENAI_API_KEY": "<YOUR_OPENAI_API_KEY>",
        "ANTHROPIC_API_KEY": "<YOUR_ANTHROPIC_API_KEY>",
        "GEMINI_API_KEY": "<YOUR_GEMINI_API_KEY>",
        "OPENROUTER_API_KEY": "<YOUR_OPENROUTER_API_KEY>",
        "AZURE_OPENAI_API_KEY": "<YOUR_AZURE_OPENAI_API_KEY>",
        "HF_TOKEN": "<YOUR_HF_TOKEN>",
        "NCBI_API_KEY": "<YOUR_NCBI_API_KEY>",
        "SEMANTIC_SCHOLAR_API_KEY": "<YOUR_SEMANTIC_SCHOLAR_API_KEY>"
      }
    }
  }
}
  1. Aktualisiere die Liste der MCP-Server in Cascade. Ersetze die Platzhalter durch deine eigenen Werte.

Devin Desktop ist der neue Name von Windsurf.

Codex

codex mcp add tooluniverse --env "OPENAI_API_KEY=<YOUR_OPENAI_API_KEY>" --env "ANTHROPIC_API_KEY=<YOUR_ANTHROPIC_API_KEY>" --env "GEMINI_API_KEY=<YOUR_GEMINI_API_KEY>" --env "OPENROUTER_API_KEY=<YOUR_OPENROUTER_API_KEY>" --env "AZURE_OPENAI_API_KEY=<YOUR_AZURE_OPENAI_API_KEY>" --env "HF_TOKEN=<YOUR_HF_TOKEN>" --env "NCBI_API_KEY=<YOUR_NCBI_API_KEY>" --env "SEMANTIC_SCHOLAR_API_KEY=<YOUR_SEMANTIC_SCHOLAR_API_KEY>" -- uvx tooluniverse

Oder bearbeite ~/.codex/config.toml direkt:

config.toml
[mcp_servers.tooluniverse]
command = "uvx"
args = ["tooluniverse"]
env = { OPENAI_API_KEY = "<YOUR_OPENAI_API_KEY>", ANTHROPIC_API_KEY = "<YOUR_ANTHROPIC_API_KEY>", GEMINI_API_KEY = "<YOUR_GEMINI_API_KEY>", OPENROUTER_API_KEY = "<YOUR_OPENROUTER_API_KEY>", AZURE_OPENAI_API_KEY = "<YOUR_AZURE_OPENAI_API_KEY>", HF_TOKEN = "<YOUR_HF_TOKEN>", NCBI_API_KEY = "<YOUR_NCBI_API_KEY>", SEMANTIC_SCHOLAR_API_KEY = "<YOUR_SEMANTIC_SCHOLAR_API_KEY>" }

Braucht uv (Python) auf deinem Rechner. Ersetze die Platzhalter durch deine eigenen Werte.

Gemini CLI

gemini mcp add -e "OPENAI_API_KEY=<YOUR_OPENAI_API_KEY>" -e "ANTHROPIC_API_KEY=<YOUR_ANTHROPIC_API_KEY>" -e "GEMINI_API_KEY=<YOUR_GEMINI_API_KEY>" -e "OPENROUTER_API_KEY=<YOUR_OPENROUTER_API_KEY>" -e "AZURE_OPENAI_API_KEY=<YOUR_AZURE_OPENAI_API_KEY>" -e "HF_TOKEN=<YOUR_HF_TOKEN>" -e "NCBI_API_KEY=<YOUR_NCBI_API_KEY>" -e "SEMANTIC_SCHOLAR_API_KEY=<YOUR_SEMANTIC_SCHOLAR_API_KEY>" tooluniverse uvx tooluniverse

Damit fügst du ihn dem aktuellen Projekt hinzu. Ergänze -s user, um ihn überall zu nutzen.

Jeder Client

Die meisten Clients, die lokale Server starten, akzeptieren diese Form:

{
  "mcpServers": {
    "tooluniverse": {
      "command": "uvx",
      "args": [
        "tooluniverse"
      ],
      "env": {
        "OPENAI_API_KEY": "<YOUR_OPENAI_API_KEY>",
        "ANTHROPIC_API_KEY": "<YOUR_ANTHROPIC_API_KEY>",
        "GEMINI_API_KEY": "<YOUR_GEMINI_API_KEY>",
        "OPENROUTER_API_KEY": "<YOUR_OPENROUTER_API_KEY>",
        "AZURE_OPENAI_API_KEY": "<YOUR_AZURE_OPENAI_API_KEY>",
        "HF_TOKEN": "<YOUR_HF_TOKEN>",
        "NCBI_API_KEY": "<YOUR_NCBI_API_KEY>",
        "SEMANTIC_SCHOLAR_API_KEY": "<YOUR_SEMANTIC_SCHOLAR_API_KEY>"
      }
    }
  }
}

Zed legt Server in seinen Einstellungen unter context_servers ab, mit denselben Feldern command, args und env.

Braucht uv (Python) auf deinem Rechner. Ersetze die Platzhalter durch deine eigenen Werte.

Einbinden

Zeig ToolUniverse in einem README oder auf deiner Website. Jede Einbindung verlinkt auf diese Seite, nutzt den Installationsbefehl des Servers und setzt keine Cookies. So funktionieren Einbindungen

Karte, iframe und JSON sind auf Englisch. Häng ?lang=it, fr, de oder es an ihre Adresse an, um eine andere Sprache zu bekommen.

README-Badge

Badge-Vorschau, hellBadge-Vorschau, dunkel
Markdown
[![ToolUniverse on mcp.tc](https://mcp.tc/i/tooluniverse/badge.svg)](https://mcp.tc/i/tooluniverse)
HTML
<a href="https://mcp.tc/i/tooluniverse"><img src="https://mcp.tc/i/tooluniverse/badge.svg" alt="ToolUniverse on mcp.tc" height="20"></a>

Es folgt dem hellen oder dunklen Modus der Lesenden. Hänge ?theme=light oder ?theme=dark an, um ihn festzulegen, oder ?style=compact, um das Zeichen ohne Schriftzug zu zeigen.

Website-Karte

HTML
<script src="https://mcp.tc/w/tooluniverse.js" async></script>

Die Karte erscheint dort, wo das Tag steht. Füge dem Tag data-theme="dark" oder data-size="compact" hinzu, um sie zu ändern. Die Datei enthält alles, was sie braucht, stellt also keine weiteren Anfragen und setzt keine Cookies.

iframe

HTML
<iframe src="https://mcp.tc/embed/tooluniverse" title="ToolUniverse on mcp.tc" width="420" height="200" loading="lazy" allow="clipboard-write" style="border:0;border-radius:8px;max-width:100%"></iframe>

Nutze es auf Seiten, die keine Skripte erlauben. Hänge ?theme=light oder ?theme=dark an die Adresse an, um die Farben festzulegen.

JSON

Der Eintrag als Daten für deine eigenen Seiten und Tools: Name, Kurzbeschreibung, Installationsbefehl, Tools und die „Add to“-Links. Jede Website kann ihn lesen (CORS ist offen).

https://mcp.tc/i/tooluniverse.json

Was jedes Feld bedeutet

KI-Prompt

Füg ihn in einen KI-Coding-Assistenten wie Claude Code oder Cursor ein, und er baut die Karte von ToolUniverse in deine Website ein.

Markdown
Füge meiner Website die mcp.tc-Karte für den MCP-Server ToolUniverse hinzu. Es ist ein einziges statisches Skript: kein Build-Schritt, kein Paket zu installieren, keine Cookies.

Setz dieses Tag dorthin, wo die Karte erscheinen soll. Die Karte erscheint direkt davor:

```html
<script src="https://mcp.tc/w/tooluniverse.js" async></script>
```

Um sie woanders zu zeigen, setz dort diesen Platzhalter ein und lade dasselbe Skript nur einmal, zum Beispiel vor `</body>`. Lass den Link darin stehen: Besucher ohne JavaScript sehen ihn.

```html
<div data-mcptc="tooluniverse"><a href="https://mcp.tc/i/tooluniverse">ToolUniverse on mcp.tc</a></div>
```

Optionen:
- `data-theme="light"` oder `"dark"` am Tag oder Platzhalter legt die Farben fest. Ohne das Attribut folgt die Karte dem hellen oder dunklen Modus der Besucher.
- `data-size="compact"` ergibt eine kleinere Karte ohne Kurzbeschreibung.
- Die CSS-Variable `--mcptc-max-width` am Platzhalter oder einem Elternelement legt die Breite fest (Standard `520px`).
- `?lang=` in der Skript-URL legt die Sprache der Karte fest: `en`, `it`, `fr`, `de` oder `es`.

Wenn die Website eine Content Security Policy hat, erlaube `script-src https://mcp.tc` und `img-src data:` (das Icon ist eingebettet).

Für ein README oder andere Markdown-Dokumentation nimm stattdessen das Badge:

```markdown
[![ToolUniverse on mcp.tc](https://mcp.tc/i/tooluniverse/badge.svg)](https://mcp.tc/i/tooluniverse)
```

Referenz: https://mcp.tc/de/embed

Änderungsverlauf

Dieser Server läuft auf deinem Computer, deshalb verfolgen wir sein PyPI-Paket: Jede neue Version erscheint hier, dazu Änderungen seines Betreibers.

Folge ToolUniverse, und wir schicken dir eine E-Mail, wenn sich etwas ändert.

  1. , Automatische Prüfung

    Beginn der Beobachtung: Version 1.5.6.

Häufige Fragen

Kann ich mcp.tc/i/tooluniverse in meinen MCP-Client einfügen?

Nein. ToolUniverse läuft auf deinem eigenen Rechner und wird von deinem Client gestartet, hat also keine Webadresse, mit der man sich verbinden könnte. Der Quick-Link ist die Seite zum Teilen; der Installationsbefehl lautet uvx tooluniverse.

Braucht ToolUniverse einen API-Schlüssel?

Ja. Er liest OPENAI_API_KEY, ANTHROPIC_API_KEY, GEMINI_API_KEY, OPENROUTER_API_KEY, AZURE_OPENAI_API_KEY, HF_TOKEN, NCBI_API_KEY und SEMANTIC_SCHOLAR_API_KEY aus seiner Umgebung, und OPENAI_API_KEY, ANTHROPIC_API_KEY, GEMINI_API_KEY, OPENROUTER_API_KEY, AZURE_OPENAI_API_KEY, HF_TOKEN, NCBI_API_KEY und SEMANTIC_SCHOLAR_API_KEY sind geheim. Trag die Werte in die Konfiguration deines Clients auf deinem eigenen Rechner ein, nie in eine geteilte Datei.

Ist ToolUniverse ein Remote- oder ein lokaler Server?

Lokal. Dein Client startet ihn mit uvx tooluniverse als Prozess auf deinem Rechner; dafür brauchst du uv (Python).

Welche Clients können ihn nutzen?

Jeder Client, der lokale Server startet: Claude Code, Claude Desktop, Cursor, VS Code, Devin Desktop, Codex, Gemini CLI, Zed und andere. claude.ai und ChatGPT verbinden sich nur mit Remote-Servern.

Verfolgt mcp.tc Änderungen an ToolUniverse?

Teilweise. Er läuft auf deinem Computer, deshalb verfolgen wir sein PyPI-Paket: Sein Tab Verlauf zeigt jede neue Version und Änderungen seines Betreibers. Folge dem Eintrag, um eine E-Mail zu bekommen, wenn er sich ändert.

Wer hat diese Seite geschrieben?

Der Roboter von mcp.tc hat die öffentlichen Metadaten von ToolUniverse (seine Paket- und Repository-Seiten) gelesen, und ein KI-Modell hat daraus den Text entworfen. Ein Mensch prüft alles, was die Prüfungen nicht bestätigen können. Der Text kann trotzdem falsch sein; wenn dir ein Fehler auffällt, nutze Eintrag melden auf dieser Seite.

mcp.tc steht in keiner Verbindung zu mims-harvard. Diese Seite entstand aus den öffentlichen Metadaten von ToolUniverse, zuletzt geprüft am 6. Okt. 2026, und ein KI-Modell hat die Beschreibung geschrieben, sie kann also Fehler enthalten. Namen und Marken gehören ihren Inhabern. Stimmt etwas nicht? Eintrag melden.