ToolUniverse

Q: ToolUniverse richiede una chiave API?

Sì. Legge OPENAI_API_KEY, ANTHROPIC_API_KEY, GEMINI_API_KEY, OPENROUTER_API_KEY, AZURE_OPENAI_API_KEY, HF_TOKEN, NCBI_API_KEY e SEMANTIC_SCHOLAR_API_KEY dal suo ambiente, e OPENAI_API_KEY, ANTHROPIC_API_KEY, GEMINI_API_KEY, OPENROUTER_API_KEY, AZURE_OPENAI_API_KEY, HF_TOKEN, NCBI_API_KEY e SEMANTIC_SCHOLAR_API_KEY sono segreti. Metti i valori nella configurazione del tuo client sul tuo computer, mai in un file condiviso.

Server MCP di mims-harvard

Give AI assistants access to thousands of scientific tools, databases and literature sources for life science and research work.

Gira in localeGira con uvxServe una chiave API

Segui

Installa ToolUniverse

Gira sul tuo computer. Il tuo client lo avvia con questo comando:

uvx tooluniverse

Richiede uv (Python) sul tuo computer. I passaggi qui sotto mostrano dove va il comando in ogni client.

OPENAI_API_KEY segreto facoltativo OpenAI API key for LLM-based tool finding and embedding features
ANTHROPIC_API_KEY segreto facoltativo Anthropic API key for Claude-based features
GEMINI_API_KEY segreto facoltativo Google Gemini API key for Gemini-based features
OPENROUTER_API_KEY segreto facoltativo OpenRouter API key for accessing 100+ LLM models
AZURE_OPENAI_API_KEY segreto facoltativo Azure OpenAI API key (alternative to OpenAI)
HF_TOKEN segreto facoltativo HuggingFace token for accessing models and datasets

Descrizione

ToolUniverse is a catalog of scientific tools for AI scientist workflows, covering machine learning models, datasets, APIs and scientific packages. It supports literature search across PubMed, Semantic Scholar, ArXiv, BioRxiv and Europe PMC, plus life science databases for genes, diseases, proteins and drugs. A compact mode reduces the large tool set to a few discovery tools to save context.

It runs locally over stdio from the PyPI package tooluniverse, started with uvx. It needs Python 3.10 or newer. No API key is required to start. Optional keys (NCBI, Semantic Scholar, BioGRID, DisGeNET, OMIM, OncoKB, OpenAI, Anthropic, Gemini, HuggingFace) raise rate limits or enable extra features.

Cosa puoi fare

Search literature across PubMed, Semantic Scholar, ArXiv, BioRxiv and Europe PMC
Query gene, disease, protein interaction and oncology databases
Discover tools through a compact mode with a few core discovery tools
Run long tasks asynchronously with progress tracking
Chain tools into sequential or parallel workflows
Cache results locally for repeat queries and offline use

Tool

I server locali mostrano i loro tool solo quando sono in esecuzione, e questo non pubblica l’elenco in anticipo. Il tuo client li mostra dopo che lo hai aggiunto.

Prompt di esempio

Find recent PubMed papers on KRAS inhibitors in lung cancer
Which genes are associated with Marfan syndrome according to DisGeNET?
List protein interaction partners of TP53 from BioGRID
Search ArXiv and BioRxiv for preprints on protein structure prediction

Configurazione

Ogni client avvia ToolUniverse sul tuo computer con lo stesso comando. Scegli il tuo; la pagina ricorda la tua scelta.

Claude Code

Eseguilo in un terminale, nella cartella del tuo progetto:

claude mcp add --transport stdio tooluniverse --env "OPENAI_API_KEY=<YOUR_OPENAI_API_KEY>" --env "ANTHROPIC_API_KEY=<YOUR_ANTHROPIC_API_KEY>" --env "GEMINI_API_KEY=<YOUR_GEMINI_API_KEY>" --env "OPENROUTER_API_KEY=<YOUR_OPENROUTER_API_KEY>" --env "AZURE_OPENAI_API_KEY=<YOUR_AZURE_OPENAI_API_KEY>" --env "HF_TOKEN=<YOUR_HF_TOKEN>" --env "NCBI_API_KEY=<YOUR_NCBI_API_KEY>" --env "SEMANTIC_SCHOLAR_API_KEY=<YOUR_SEMANTIC_SCHOLAR_API_KEY>" -- uvx tooluniverse

Avvia Claude Code e digita /mcp. tooluniverse dovrebbe risultare collegato.

Aggiungi --scope user per renderlo disponibile in tutti i progetti. Sostituisci i segnaposto con i tuoi valori.

Claude Desktop

Apri Settings → Developer → Edit Config. Si apre claude_desktop_config.json. Aggiungi:

claude_desktop_config.json

{
  "mcpServers": {
    "tooluniverse": {
      "command": "uvx",
      "args": [
        "tooluniverse"
      ],
      "env": {
        "OPENAI_API_KEY": "<YOUR_OPENAI_API_KEY>",
        "ANTHROPIC_API_KEY": "<YOUR_ANTHROPIC_API_KEY>",
        "GEMINI_API_KEY": "<YOUR_GEMINI_API_KEY>",
        "OPENROUTER_API_KEY": "<YOUR_OPENROUTER_API_KEY>",
        "AZURE_OPENAI_API_KEY": "<YOUR_AZURE_OPENAI_API_KEY>",
        "HF_TOKEN": "<YOUR_HF_TOKEN>",
        "NCBI_API_KEY": "<YOUR_NCBI_API_KEY>",
        "SEMANTIC_SCHOLAR_API_KEY": "<YOUR_SEMANTIC_SCHOLAR_API_KEY>"
      }
    }
  }
}

Salva il file e riavvia Claude Desktop. Sostituisci i segnaposto con i tuoi valori.

Richiede uv (Python) sul tuo computer. Il file si trova in ~/Library/Application Support/Claude/ su macOS e in %APPDATA%\Claude\ su Windows.

Cursor

Oppure aggiungilo a mano in ~/.cursor/mcp.json (tutti i progetti) o in .cursor/mcp.json (questo progetto):

mcp.json

{
  "mcpServers": {
    "tooluniverse": {
      "command": "uvx",
      "args": [
        "tooluniverse"
      ],
      "env": {
        "OPENAI_API_KEY": "<YOUR_OPENAI_API_KEY>",
        "ANTHROPIC_API_KEY": "<YOUR_ANTHROPIC_API_KEY>",
        "GEMINI_API_KEY": "<YOUR_GEMINI_API_KEY>",
        "OPENROUTER_API_KEY": "<YOUR_OPENROUTER_API_KEY>",
        "AZURE_OPENAI_API_KEY": "<YOUR_AZURE_OPENAI_API_KEY>",
        "HF_TOKEN": "<YOUR_HF_TOKEN>",
        "NCBI_API_KEY": "<YOUR_NCBI_API_KEY>",
        "SEMANTIC_SCHOLAR_API_KEY": "<YOUR_SEMANTIC_SCHOLAR_API_KEY>"
      }
    }
  }
}

Richiede uv (Python) sul tuo computer. Sostituisci i segnaposto con i tuoi valori.

VS Code

Aggiungilo a .vscode/mcp.json. VS Code chiede il segreto la prima volta e lo conserva in modo sicuro:

.vscode/mcp.json

{
  "servers": {
    "tooluniverse": {
      "type": "stdio",
      "command": "uvx",
      "args": [
        "tooluniverse"
      ],
      "env": {
        "OPENAI_API_KEY": "${input:openai-api-key}",
        "ANTHROPIC_API_KEY": "${input:anthropic-api-key}",
        "GEMINI_API_KEY": "${input:gemini-api-key}",
        "OPENROUTER_API_KEY": "${input:openrouter-api-key}",
        "AZURE_OPENAI_API_KEY": "${input:azure-openai-api-key}",
        "HF_TOKEN": "${input:hf-token}",
        "NCBI_API_KEY": "${input:ncbi-api-key}",
        "SEMANTIC_SCHOLAR_API_KEY": "${input:semantic-scholar-api-key}"
      }
    }
  },
  "inputs": [
    {
      "type": "promptString",
      "id": "openai-api-key",
      "description": "OPENAI_API_KEY",
      "password": true
    },
    {
      "type": "promptString",
      "id": "anthropic-api-key",
      "description": "ANTHROPIC_API_KEY",
      "password": true
    },
    {
      "type": "promptString",
      "id": "gemini-api-key",
      "description": "GEMINI_API_KEY",
      "password": true
    },
    {
      "type": "promptString",
      "id": "openrouter-api-key",
      "description": "OPENROUTER_API_KEY",
      "password": true
    },
    {
      "type": "promptString",
      "id": "azure-openai-api-key",
      "description": "AZURE_OPENAI_API_KEY",
      "password": true
    },
    {
      "type": "promptString",
      "id": "hf-token",
      "description": "HF_TOKEN",
      "password": true
    },
    {
      "type": "promptString",
      "id": "ncbi-api-key",
      "description": "NCBI_API_KEY",
      "password": true
    },
    {
      "type": "promptString",
      "id": "semantic-scholar-api-key",
      "description": "SEMANTIC_SCHOLAR_API_KEY",
      "password": true
    }
  ]
}

Richiede uv (Python) sul tuo computer.

Devin Desktop

Aggiungilo a ~/.config/devin/mcp_config.json (macOS e Linux) o a %APPDATA%\devin\mcp_config.json (Windows):

mcp_config.json

{
  "mcpServers": {
    "tooluniverse": {
      "command": "uvx",
      "args": [
        "tooluniverse"
      ],
      "env": {
        "OPENAI_API_KEY": "<YOUR_OPENAI_API_KEY>",
        "ANTHROPIC_API_KEY": "<YOUR_ANTHROPIC_API_KEY>",
        "GEMINI_API_KEY": "<YOUR_GEMINI_API_KEY>",
        "OPENROUTER_API_KEY": "<YOUR_OPENROUTER_API_KEY>",
        "AZURE_OPENAI_API_KEY": "<YOUR_AZURE_OPENAI_API_KEY>",
        "HF_TOKEN": "<YOUR_HF_TOKEN>",
        "NCBI_API_KEY": "<YOUR_NCBI_API_KEY>",
        "SEMANTIC_SCHOLAR_API_KEY": "<YOUR_SEMANTIC_SCHOLAR_API_KEY>"
      }
    }
  }
}

Aggiorna l’elenco dei server MCP in Cascade. Sostituisci i segnaposto con i tuoi valori.

Devin Desktop è il nuovo nome di Windsurf.

Codex

codex mcp add tooluniverse --env "OPENAI_API_KEY=<YOUR_OPENAI_API_KEY>" --env "ANTHROPIC_API_KEY=<YOUR_ANTHROPIC_API_KEY>" --env "GEMINI_API_KEY=<YOUR_GEMINI_API_KEY>" --env "OPENROUTER_API_KEY=<YOUR_OPENROUTER_API_KEY>" --env "AZURE_OPENAI_API_KEY=<YOUR_AZURE_OPENAI_API_KEY>" --env "HF_TOKEN=<YOUR_HF_TOKEN>" --env "NCBI_API_KEY=<YOUR_NCBI_API_KEY>" --env "SEMANTIC_SCHOLAR_API_KEY=<YOUR_SEMANTIC_SCHOLAR_API_KEY>" -- uvx tooluniverse

Oppure modifica direttamente ~/.codex/config.toml:

config.toml

[mcp_servers.tooluniverse]
command = "uvx"
args = ["tooluniverse"]
env = { OPENAI_API_KEY = "<YOUR_OPENAI_API_KEY>", ANTHROPIC_API_KEY = "<YOUR_ANTHROPIC_API_KEY>", GEMINI_API_KEY = "<YOUR_GEMINI_API_KEY>", OPENROUTER_API_KEY = "<YOUR_OPENROUTER_API_KEY>", AZURE_OPENAI_API_KEY = "<YOUR_AZURE_OPENAI_API_KEY>", HF_TOKEN = "<YOUR_HF_TOKEN>", NCBI_API_KEY = "<YOUR_NCBI_API_KEY>", SEMANTIC_SCHOLAR_API_KEY = "<YOUR_SEMANTIC_SCHOLAR_API_KEY>" }

Richiede uv (Python) sul tuo computer. Sostituisci i segnaposto con i tuoi valori.

Gemini CLI

gemini mcp add -e "OPENAI_API_KEY=<YOUR_OPENAI_API_KEY>" -e "ANTHROPIC_API_KEY=<YOUR_ANTHROPIC_API_KEY>" -e "GEMINI_API_KEY=<YOUR_GEMINI_API_KEY>" -e "OPENROUTER_API_KEY=<YOUR_OPENROUTER_API_KEY>" -e "AZURE_OPENAI_API_KEY=<YOUR_AZURE_OPENAI_API_KEY>" -e "HF_TOKEN=<YOUR_HF_TOKEN>" -e "NCBI_API_KEY=<YOUR_NCBI_API_KEY>" -e "SEMANTIC_SCHOLAR_API_KEY=<YOUR_SEMANTIC_SCHOLAR_API_KEY>" tooluniverse uvx tooluniverse

Così lo aggiungi al progetto corrente. Aggiungi -s user per usarlo ovunque.

Qualsiasi client

La maggior parte dei client che avviano server locali accetta questa forma:

{
  "mcpServers": {
    "tooluniverse": {
      "command": "uvx",
      "args": [
        "tooluniverse"
      ],
      "env": {
        "OPENAI_API_KEY": "<YOUR_OPENAI_API_KEY>",
        "ANTHROPIC_API_KEY": "<YOUR_ANTHROPIC_API_KEY>",
        "GEMINI_API_KEY": "<YOUR_GEMINI_API_KEY>",
        "OPENROUTER_API_KEY": "<YOUR_OPENROUTER_API_KEY>",
        "AZURE_OPENAI_API_KEY": "<YOUR_AZURE_OPENAI_API_KEY>",
        "HF_TOKEN": "<YOUR_HF_TOKEN>",
        "NCBI_API_KEY": "<YOUR_NCBI_API_KEY>",
        "SEMANTIC_SCHOLAR_API_KEY": "<YOUR_SEMANTIC_SCHOLAR_API_KEY>"
      }
    }
  }
}

Zed mette i server sotto context_servers nelle sue impostazioni, con gli stessi campi command, args ed env.

Richiede uv (Python) sul tuo computer. Sostituisci i segnaposto con i tuoi valori.

Embed

Mostra ToolUniverse in un README o sul tuo sito. Ogni embed rimanda a questa pagina, usa il comando di installazione del server e non imposta cookie. Come funzionano gli embed

Lingua dell’embed

Card, iframe e JSON sono in inglese. Aggiungi ?lang=it, fr, de o es al loro indirizzo per un’altra lingua.

Badge per il README

Markdown

[![ToolUniverse on mcp.tc](https://mcp.tc/i/tooluniverse/badge.svg)](https://mcp.tc/i/tooluniverse)

HTML

<a href="https://mcp.tc/i/tooluniverse"><img src="https://mcp.tc/i/tooluniverse/badge.svg" alt="ToolUniverse on mcp.tc" height="20"></a>

Segue la modalità chiara o scura di chi legge. Aggiungi ?theme=light o ?theme=dark per fissarla, oppure ?style=compact per mostrare il simbolo senza la scritta.

Card per il sito

HTML

<script src="https://mcp.tc/w/tooluniverse.js" async></script>

La card compare dove si trova il tag. Aggiungi data-theme="dark" o data-size="compact" al tag per cambiarla. Il file contiene tutto ciò che serve, quindi non fa altre richieste e non imposta cookie.

iframe

HTML

<iframe src="https://mcp.tc/embed/tooluniverse" title="ToolUniverse on mcp.tc" width="420" height="200" loading="lazy" allow="clipboard-write" style="border:0;border-radius:8px;max-width:100%"></iframe>

Usalo nelle pagine che non consentono script. Aggiungi ?theme=light o ?theme=dark all’indirizzo per fissare i colori.

JSON

La scheda come dati per le tue pagine e i tuoi strumenti: nome, descrizione breve, comando di installazione, tool e i link «Add to». Qualsiasi sito può leggerla (CORS aperto).

https://mcp.tc/i/tooluniverse.json

Cosa significa ogni campo

Prompt per l’AI

Incollalo in un assistente di programmazione con l’AI, come Claude Code o Cursor, e aggiungerà la card di ToolUniverse al tuo sito.

Markdown

Aggiungi al mio sito la card di mcp.tc per ToolUniverse, un server MCP. È un solo script statico: niente build, nessun pacchetto da installare, nessun cookie.

Metti questo tag dove deve comparire la card. La card appare subito prima del tag:

```html
<script src="https://mcp.tc/w/tooluniverse.js" async></script>
```

Per mostrarla altrove, metti lì questo segnaposto e carica lo stesso script una volta sola, per esempio prima di `</body>`. Lascia il link al suo interno: lo vede chi non ha JavaScript.

```html
<div data-mcptc="tooluniverse"><a href="https://mcp.tc/i/tooluniverse">ToolUniverse on mcp.tc</a></div>
```

Opzioni:
- `data-theme="light"` o `"dark"` sul tag o sul segnaposto fissa i colori. Senza l’attributo, la card segue la modalità chiara o scura di chi visita.
- `data-size="compact"` dà una card più piccola, senza la descrizione breve.
- La variabile CSS `--mcptc-max-width` sul segnaposto o su un elemento padre imposta la larghezza (predefinita `520px`).
- `?lang=` nell’URL dello script imposta la lingua della card: `en`, `it`, `fr`, `de` o `es`.

Se il sito ha una Content Security Policy, consenti `script-src https://mcp.tc` e `img-src data:` (l’icona è inline).

Per un README o altra documentazione in Markdown, usa invece il badge:

```markdown
[![ToolUniverse on mcp.tc](https://mcp.tc/i/tooluniverse/badge.svg)](https://mcp.tc/i/tooluniverse)
```

Riferimento: https://mcp.tc/it/embed

Cronologia delle modifiche

Questo server gira sul tuo computer, quindi seguiamo il suo pacchetto PyPI: qui compare ogni nuova versione, insieme alle modifiche di chi lo gestisce.

Segui ToolUniverse e ti mandiamo un’email quando qualcosa cambia.

Segui Feed Atom

6 ott 2026, 21:23 UTC, Controllo automatico

Inizio del tracciamento: versione 1.5.6.

Domande frequenti

Posso incollare mcp.tc/i/tooluniverse nel mio client MCP?

No. ToolUniverse gira sul tuo computer, avviato dal tuo client, quindi non ha un indirizzo web a cui collegarsi. Il link rapido è la pagina da condividere; il comando di installazione è uvx tooluniverse.

ToolUniverse richiede una chiave API?

Sì. Legge OPENAI_API_KEY, ANTHROPIC_API_KEY, GEMINI_API_KEY, OPENROUTER_API_KEY, AZURE_OPENAI_API_KEY, HF_TOKEN, NCBI_API_KEY e SEMANTIC_SCHOLAR_API_KEY dal suo ambiente, e OPENAI_API_KEY, ANTHROPIC_API_KEY, GEMINI_API_KEY, OPENROUTER_API_KEY, AZURE_OPENAI_API_KEY, HF_TOKEN, NCBI_API_KEY e SEMANTIC_SCHOLAR_API_KEY sono segreti. Metti i valori nella configurazione del tuo client sul tuo computer, mai in un file condiviso.

ToolUniverse è un server remoto o locale?

Locale. Il tuo client lo avvia come processo sul tuo computer con uvx tooluniverse, che richiede uv (Python).

Quali client possono usarlo?

Qualsiasi client che avvia server locali: Claude Code, Claude Desktop, Cursor, VS Code, Devin Desktop, Codex, Gemini CLI, Zed e altri. claude.ai e ChatGPT si collegano solo a server remoti.

mcp.tc tiene traccia delle modifiche di ToolUniverse?

In parte. Gira sul tuo computer, quindi seguiamo il suo pacchetto PyPI: la sua sezione Cronologia mostra ogni nuova versione e le modifiche di chi lo gestisce. Segui la scheda per ricevere un’email quando cambia.

Chi ha scritto questa pagina?

Il robot di mcp.tc ha letto i metadati pubblici di ToolUniverse (le pagine del suo pacchetto e del repository), e un modello di AI ne ha ricavato il testo. Una persona esamina tutto ciò che i controlli non riescono a confermare. Il testo può comunque contenere errori, quindi se ne trovi uno usa Segnala questa scheda su questa pagina.

mcp.tc non è affiliato a mims-harvard. Questa pagina è stata creata a partire dai metadati pubblici di ToolUniverse (ultimo controllo: 6 ott 2026), e la descrizione l’ha scritta un modello di AI, quindi può contenere errori. Nomi e marchi appartengono ai rispettivi titolari. Qualcosa non va? Segnala questa scheda.

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