AlphaFold Sovereign

Présentation

Encapsule AlphaFold DB, MONDO, HPO, Open Targets, ClinVar, gnomAD, DisGeNET, ChEMBL et Ensembl derrière des appels d’outils MCP. Il les combine aussi en workflows multi-sources : rapports de références croisées de variants, résumés maladie-cible, score heuristique de druggabilité, classement de repositionnement de médicaments et comparaison de distance structurale par empreintes d’homologie persistante. Un graphe de connaissances SQLite local propose des outils de requête, d’export et de parcours.

S’exécute comme processus Python local via stdio, lancé avec uvx alphafold-sovereign-mcp (Python 3.10 à 3.13). En mode en ligne, les outils envoient des identifiants aux API publiques en amont, et DisGeNET demande sa propre clé API gratuite. Définir ALPHAFOLD_OFFLINE=1 bloque les requêtes sortantes. Les résultats sont des aides à la recherche, non destinées à un usage clinique sans validation par un expert.

Ce que vous pouvez faire

• Récupérer les données de structure protéique d’AlphaFold DB
• Interroger ClinVar, gnomAD, Ensembl, ChEMBL et Open Targets
• Rechercher des termes de maladies et de phénotypes dans MONDO et HPO
• Générer des brouillons de rapports de références croisées de variants
• Évaluer la druggabilité d’une cible avec un niveau heuristique
• Comparer des protéines par distance structurale topologique
• Interroger et exporter un graphe de connaissances SQLite local
• Fonctionner hors ligne pour qu’aucun identifiant ne quitte la machine

Outils

Les serveurs locaux présentent leurs outils une fois lancés, nous ne pouvons donc pas les afficher ici. Cherchez la liste dans sa documentation ; votre client les affiche après l’ajout.

Exemples de prompts

• Récupère la structure AlphaFold de TP53 humaine et résume sa confiance pLDDT

• Construis un rapport de références croisées de variants pour BRCA1 c.5266dupC

• Évalue la druggabilité d’EGFR avec les données Open Targets et ChEMBL

• Montre les maladies liées à une cible dans le graphe de connaissances local

Configuration

Chaque client lance AlphaFold Sovereign sur votre machine avec la même commande. Choisissez le vôtre ; la page retient votre choix.

claude mcp add --transport stdio alphafold-sovereign -- uvx alphafold-sovereign-mcp

{
  "mcpServers": {
    "alphafold-sovereign": {
      "command": "uvx",
      "args": [
        "alphafold-sovereign-mcp"
      ]
    }
  }
}

{
  "mcpServers": {
    "alphafold-sovereign": {
      "command": "uvx",
      "args": [
        "alphafold-sovereign-mcp"
      ]
    }
  }
}

code --add-mcp '{"name":"alphafold-sovereign","type":"stdio","command":"uvx","args":["alphafold-sovereign-mcp"]}'

{
  "servers": {
    "alphafold-sovereign": {
      "type": "stdio",
      "command": "uvx",
      "args": [
        "alphafold-sovereign-mcp"
      ]
    }
  }
}

{
  "mcpServers": {
    "alphafold-sovereign": {
      "command": "uvx",
      "args": [
        "alphafold-sovereign-mcp"
      ]
    }
  }
}

codex mcp add alphafold-sovereign -- uvx alphafold-sovereign-mcp

[mcp_servers.alphafold-sovereign]
command = "uvx"
args = ["alphafold-sovereign-mcp"]

gemini mcp add alphafold-sovereign uvx alphafold-sovereign-mcp

{
  "mcpServers": {
    "alphafold-sovereign": {
      "command": "uvx",
      "args": [
        "alphafold-sovereign-mcp"
      ]
    }
  }
}

Intégrer

Affichez AlphaFold Sovereign dans un README ou sur votre site. Chaque intégration renvoie à cette page, utilise la commande d’installation du serveur et ne dépose aucun cookie. Comment fonctionnent les intégrations

La carte, l’iframe et le JSON sont en anglais. Ajoutez ?lang=it, fr, de ou es à leur adresse pour une autre langue.

Badge pour README Carte pour site web iframe JSON Prompt pour l’IA

Badge pour README

Markdown

[![AlphaFold Sovereign on mcp.tc](https://mcp.tc/i/alphafold-sovereign/badge.svg)](https://mcp.tc/i/alphafold-sovereign)

HTML

<a href="https://mcp.tc/i/alphafold-sovereign"><img src="https://mcp.tc/i/alphafold-sovereign/badge.svg" alt="AlphaFold Sovereign on mcp.tc" height="20"></a>

Il suit le mode clair ou sombre du lecteur. Ajoutez ?theme=light ou ?theme=dark pour le fixer, ou ?style=compact pour afficher le symbole sans le nom.

Carte pour site web

HTML

<script src="https://mcp.tc/w/alphafold-sovereign.js" async></script>

La carte apparaît à l’endroit de la balise. Ajoutez data-theme="dark" ou data-size="compact" à la balise pour la modifier. Le fichier contient tout ce qu’il lui faut : il ne fait aucune autre requête et ne dépose aucun cookie.

iframe

HTML

<iframe src="https://mcp.tc/embed/alphafold-sovereign" title="AlphaFold Sovereign on mcp.tc" width="420" height="200" loading="lazy" allow="clipboard-write" style="border:0;border-radius:8px;max-width:100%"></iframe>

Utilisez-la sur les pages qui n’autorisent pas les scripts. Ajoutez ?theme=light ou ?theme=dark à l’adresse pour fixer les couleurs.

JSON

La fiche sous forme de données pour vos pages et vos outils : nom, accroche, commande d’installation, outils et liens « Add to ». N’importe quel site peut la lire (CORS ouvert).

https://mcp.tc/i/alphafold-sovereign.json

Ce que signifie chaque champ

Prompt pour l’IA

Collez-le dans un assistant de code IA, comme Claude Code ou Cursor, et il ajoutera la carte de AlphaFold Sovereign à votre site.

Markdown

Ajoute à mon site la carte mcp.tc de AlphaFold Sovereign, un serveur MCP. C’est un seul script statique : pas de build, aucun paquet à installer, aucun cookie.

Place cette balise là où la carte doit apparaître. La carte s’affiche juste avant elle :

```html
<script src="https://mcp.tc/w/alphafold-sovereign.js" async></script>
```

Pour l’afficher ailleurs, mets ce conteneur à cet endroit et charge le même script une seule fois, par exemple avant `</body>`. Garde le lien à l’intérieur : les visiteurs sans JavaScript le voient.

```html
<div data-mcptc="alphafold-sovereign"><a href="https://mcp.tc/i/alphafold-sovereign">AlphaFold Sovereign on mcp.tc</a></div>
```

Options :
- `data-theme="light"` ou `"dark"` sur la balise ou le conteneur fixe les couleurs. Sans cela, la carte suit le mode clair ou sombre du visiteur.
- `data-size="compact"` donne une carte plus petite, sans l’accroche.
- La variable CSS `--mcptc-max-width` sur le conteneur ou un parent fixe la largeur (`520px` par défaut).
- `?lang=` dans l’URL du script choisit la langue de la carte : `en`, `it`, `fr`, `de` ou `es`.

Si le site a une Content Security Policy, autorise `script-src https://mcp.tc` et `img-src data:` (l’icône est intégrée).

Pour un README ou une autre doc en Markdown, utilise plutôt le badge :

```markdown
[![AlphaFold Sovereign on mcp.tc](https://mcp.tc/i/alphafold-sovereign/badge.svg)](https://mcp.tc/i/alphafold-sovereign)
```

Référence : https://mcp.tc/fr/embed

Historique des changements

Ce serveur tourne sur votre ordinateur, donc nous suivons son paquet PyPI : chaque nouvelle version apparaît ici, avec les modifications de son propriétaire.

1. 6 oct. 2026, 21:21 UTC, Vérification automatique

   Début de l’observation : version 1.4.10.

FAQ