AlphaFold Sovereign

Descrizione

Racchiude AlphaFold DB, MONDO, HPO, Open Targets, ClinVar, gnomAD, DisGeNET, ChEMBL ed Ensembl dietro chiamate ai tool MCP. Le combina anche in workflow multi-fonte come report di riferimenti incrociati di varianti, riepiloghi malattia-target, punteggio euristico di druggability, classifica per riposizionamento dei farmaci e confronto della distanza strutturale tramite impronte di omologia persistente. Un knowledge graph SQLite locale offre tool di query, esportazione e traversal.

Si esegue come processo Python locale tramite stdio, avviato con uvx alphafold-sovereign-mcp (Python da 3.10 a 3.13). In modalità online i tool inviano gli identificatori alle API pubbliche upstream, e DisGeNET richiede una propria chiave API gratuita. Impostando ALPHAFOLD_OFFLINE=1 le richieste in uscita vengono bloccate. I risultati sono un supporto alla ricerca, non per uso clinico senza revisione di un esperto.

Cosa puoi fare

• Ottenere i dati di struttura proteica di AlphaFold DB
• Interrogare ClinVar, gnomAD, Ensembl, ChEMBL e Open Targets
• Cercare termini di malattie e fenotipi in MONDO e HPO
• Generare bozze di report di riferimenti incrociati di varianti
• Valutare la druggability di un target con un livello euristico
• Confrontare le proteine tramite distanza strutturale topologica
• Interrogare ed esportare un knowledge graph SQLite locale
• Funzionare offline, così nessun identificatore lascia la macchina

Tool

I server locali mostrano i loro tool solo quando sono in esecuzione, quindi non possiamo mostrarli qui. Cerca l’elenco nella sua documentazione; il tuo client li mostra dopo che lo hai aggiunto.

Prompt di esempio

• Ottieni la struttura AlphaFold di TP53 umano e riassumi la sua confidenza pLDDT

• Crea un report di riferimenti incrociati per la variante BRCA1 c.5266dupC

• Valuta la druggability di EGFR con i dati di Open Targets e ChEMBL

• Mostra le malattie collegate a un target nel knowledge graph locale

Configurazione

Ogni client avvia AlphaFold Sovereign sul tuo computer con lo stesso comando. Scegli il tuo; la pagina ricorda la tua scelta.

claude mcp add --transport stdio alphafold-sovereign -- uvx alphafold-sovereign-mcp

{
  "mcpServers": {
    "alphafold-sovereign": {
      "command": "uvx",
      "args": [
        "alphafold-sovereign-mcp"
      ]
    }
  }
}

{
  "mcpServers": {
    "alphafold-sovereign": {
      "command": "uvx",
      "args": [
        "alphafold-sovereign-mcp"
      ]
    }
  }
}

code --add-mcp '{"name":"alphafold-sovereign","type":"stdio","command":"uvx","args":["alphafold-sovereign-mcp"]}'

{
  "servers": {
    "alphafold-sovereign": {
      "type": "stdio",
      "command": "uvx",
      "args": [
        "alphafold-sovereign-mcp"
      ]
    }
  }
}

{
  "mcpServers": {
    "alphafold-sovereign": {
      "command": "uvx",
      "args": [
        "alphafold-sovereign-mcp"
      ]
    }
  }
}

codex mcp add alphafold-sovereign -- uvx alphafold-sovereign-mcp

[mcp_servers.alphafold-sovereign]
command = "uvx"
args = ["alphafold-sovereign-mcp"]

gemini mcp add alphafold-sovereign uvx alphafold-sovereign-mcp

{
  "mcpServers": {
    "alphafold-sovereign": {
      "command": "uvx",
      "args": [
        "alphafold-sovereign-mcp"
      ]
    }
  }
}

Embed

Mostra AlphaFold Sovereign in un README o sul tuo sito. Ogni embed rimanda a questa pagina, usa il comando di installazione del server e non imposta cookie. Come funzionano gli embed

Card, iframe e JSON sono in inglese. Aggiungi ?lang=it, fr, de o es al loro indirizzo per un’altra lingua.

Badge per il README Card per il sito iframe JSON Prompt per l’AI

Badge per il README

Markdown

[![AlphaFold Sovereign on mcp.tc](https://mcp.tc/i/alphafold-sovereign/badge.svg)](https://mcp.tc/i/alphafold-sovereign)

HTML

<a href="https://mcp.tc/i/alphafold-sovereign"><img src="https://mcp.tc/i/alphafold-sovereign/badge.svg" alt="AlphaFold Sovereign on mcp.tc" height="20"></a>

Segue la modalità chiara o scura di chi legge. Aggiungi ?theme=light o ?theme=dark per fissarla, oppure ?style=compact per mostrare il simbolo senza la scritta.

Card per il sito

HTML

<script src="https://mcp.tc/w/alphafold-sovereign.js" async></script>

La card compare dove si trova il tag. Aggiungi data-theme="dark" o data-size="compact" al tag per cambiarla. Il file contiene tutto ciò che serve, quindi non fa altre richieste e non imposta cookie.

iframe

HTML

<iframe src="https://mcp.tc/embed/alphafold-sovereign" title="AlphaFold Sovereign on mcp.tc" width="420" height="200" loading="lazy" allow="clipboard-write" style="border:0;border-radius:8px;max-width:100%"></iframe>

Usalo nelle pagine che non consentono script. Aggiungi ?theme=light o ?theme=dark all’indirizzo per fissare i colori.

JSON

La scheda come dati per le tue pagine e i tuoi strumenti: nome, descrizione breve, comando di installazione, tool e i link «Add to». Qualsiasi sito può leggerla (CORS aperto).

https://mcp.tc/i/alphafold-sovereign.json

Cosa significa ogni campo

Prompt per l’AI

Incollalo in un assistente di programmazione con l’AI, come Claude Code o Cursor, e aggiungerà la card di AlphaFold Sovereign al tuo sito.

Markdown

Aggiungi al mio sito la card di mcp.tc per AlphaFold Sovereign, un server MCP. È un solo script statico: niente build, nessun pacchetto da installare, nessun cookie.

Metti questo tag dove deve comparire la card. La card appare subito prima del tag:

```html
<script src="https://mcp.tc/w/alphafold-sovereign.js" async></script>
```

Per mostrarla altrove, metti lì questo segnaposto e carica lo stesso script una volta sola, per esempio prima di `</body>`. Lascia il link al suo interno: lo vede chi non ha JavaScript.

```html
<div data-mcptc="alphafold-sovereign"><a href="https://mcp.tc/i/alphafold-sovereign">AlphaFold Sovereign on mcp.tc</a></div>
```

Opzioni:
- `data-theme="light"` o `"dark"` sul tag o sul segnaposto fissa i colori. Senza l’attributo, la card segue la modalità chiara o scura di chi visita.
- `data-size="compact"` dà una card più piccola, senza la descrizione breve.
- La variabile CSS `--mcptc-max-width` sul segnaposto o su un elemento padre imposta la larghezza (predefinita `520px`).
- `?lang=` nell’URL dello script imposta la lingua della card: `en`, `it`, `fr`, `de` o `es`.

Se il sito ha una Content Security Policy, consenti `script-src https://mcp.tc` e `img-src data:` (l’icona è inline).

Per un README o altra documentazione in Markdown, usa invece il badge:

```markdown
[![AlphaFold Sovereign on mcp.tc](https://mcp.tc/i/alphafold-sovereign/badge.svg)](https://mcp.tc/i/alphafold-sovereign)
```

Riferimento: https://mcp.tc/it/embed

Cronologia delle modifiche

Questo server gira sul tuo computer, quindi seguiamo il suo pacchetto PyPI: qui compare ogni nuova versione, insieme alle modifiche di chi lo gestisce.

1. 6 ott 2026, 21:21 UTC, Controllo automatico

   Inizio del tracciamento: versione 1.4.10.

Domande frequenti